Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
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COL4A6Q14031 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL4A6Q14031 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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COL4A6Q14031 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL4A6Q14031 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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COL4A6Q14031 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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COL4A6Q14031 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL4A6Q14031 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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COL4A6Q14031 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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COL4A6Q14031 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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COL4A6Q14031 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL4A6Q14031 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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COL4A6Q14031 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL4A6Q14031 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms