Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CIRBPQ14011 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CIRBPQ14011 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CIRBPQ14011 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIRBPQ14011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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