Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF1Q13905 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAPGEF1Q13905 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF1Q13905 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF1Q13905 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEF1Q13905 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF1Q13905 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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