Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2H3Q13889 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2H3Q13889 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2H3Q13889 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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