Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTR4Q13639 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR4Q13639 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR4Q13639 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR4Q13639 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTR4Q13639 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTR4Q13639 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTR4Q13639 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HTR4Q13639 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HTR4Q13639 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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