Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
IRF5Q13568 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRF5Q13568 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF5Q13568 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IRF5Q13568 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
IRF5Q13568 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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