Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf61Q13536 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf61Q13536 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf61Q13536 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms