Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SQSTM1Q13501 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SQSTM1Q13501 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SQSTM1Q13501 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SQSTM1Q13501 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SQSTM1Q13501 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SQSTM1Q13501 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SQSTM1Q13501 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SQSTM1Q13501 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SQSTM1Q13501 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SQSTM1Q13501 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms