Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSAMPQ13449 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSAMPQ13449 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSAMPQ13449 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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