Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED1Q13445 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED1Q13445 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMED1Q13445 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMED1Q13445 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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