Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MKRN4PQ13434 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN4PQ13434 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MKRN4PQ13434 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MKRN4PQ13434 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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