Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL49Q13405 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL49Q13405 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL49Q13405 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL49Q13405 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms