Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA1Q13330 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA1Q13330 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTA1Q13330 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTA1Q13330 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTA1Q13330 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTA1Q13330 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTA1Q13330 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTA1Q13330 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTA1Q13330 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MTA1Q13330 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTA1Q13330 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
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