Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5R2Q13319 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK5R2Q13319 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5R2Q13319 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK5R2Q13319 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK5R2Q13319 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms