Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTK7Q13308 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTK7Q13308 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTK7Q13308 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTK7Q13308 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK7Q13308 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
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