Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLN3Q13286 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLN3Q13286 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLN3Q13286 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN3Q13286 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLN3Q13286 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CLN3Q13286 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
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