Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NME3Q13232 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NME3Q13232 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NME3Q13232 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NME3Q13232 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NME3Q13232 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NME3Q13232 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NME3Q13232 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NME3Q13232 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME3Q13232 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME3Q13232 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME3Q13232 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME3Q13232 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NME3Q13232 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME3Q13232 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME3Q13232 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME3Q13232 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NME3Q13232 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME3Q13232 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME3Q13232 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME3Q13232 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME3Q13232 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME3Q13232 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME3Q13232 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME3Q13232 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME3Q13232 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME3Q13232 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME3Q13232 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME3Q13232 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME3Q13232 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NME3Q13232 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME3Q13232 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME3Q13232 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME3Q13232 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME3Q13232 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NME3Q13232 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME3Q13232 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME3Q13232 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME3Q13232 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME3Q13232 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME3Q13232 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME3Q13232 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME3Q13232 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME3Q13232 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NME3Q13232 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME3Q13232 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NME3Q13232 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NME3Q13232 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME3Q13232 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME3Q13232 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME3Q13232 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME3Q13232 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME3Q13232 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME3Q13232 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME3Q13232 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME3Q13232 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME3Q13232 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME3Q13232 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME3Q13232 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NME3Q13232 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NME3Q13232 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NME3Q13232 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME3Q13232 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME3Q13232 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME3Q13232 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME3Q13232 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME3Q13232 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME3Q13232 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME3Q13232 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME3Q13232 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME3Q13232 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME3Q13232 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME3Q13232 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME3Q13232 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME3Q13232 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NME3Q13232 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME3Q13232 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME3Q13232 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME3Q13232 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME3Q13232 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME3Q13232 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME3Q13232 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME3Q13232 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME3Q13232 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME3Q13232 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME3Q13232 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME3Q13232 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME3Q13232 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME3Q13232 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME3Q13232 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME3Q13232 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NME3Q13232 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NME3Q13232 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
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