Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
GRIN2BQ13224 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
GRIN2BQ13224 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
GRIN2BQ13224 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
GRIN2BQ13224 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
GRIN2BQ13224 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
GRIN2BQ13224 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
GRIN2BQ13224 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.21■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.19■■■■■ 4.51
GRIN2BQ13224 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
GRIN2BQ13224 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
GRIN2BQ13224 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
GRIN2BQ13224 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
GRIN2BQ13224 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
GRIN2BQ13224 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
GRIN2BQ13224 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
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