Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	YJL009W	YJL009W	327 nt		7.81	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	YPT11	YNL304W	1254 nt		7.81	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	ATO2	YNR002C	849 nt		7.81	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	RPL2A	YFR031C-A	765 nt		7.79	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	MET13	YGL125W	1803 nt		7.79	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	YNL040W	YNL040W	1371 nt		7.79	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	YEL023C	YEL023C	2049 nt		7.78	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	PAR32	YDL173W	888 nt		7.78	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	SGF73	YGL066W	1974 nt		7.78	□□□□□ -1.16
VIK1	Q12045	YIL108W	YIL108W	2091 nt		7.77	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	MAS2	YHR024C	1449 nt		7.76	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	YEL008W	YEL008W	381 nt		7.75	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	APS2	YJR058C	444 nt		7.74	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	YBR056W	YBR056W	1506 nt		7.73	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	INM1	YHR046C	888 nt		7.73	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	YIR035C	YIR035C	765 nt		7.73	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	SPE2	YOL052C	1191 nt		7.73	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	FUN14	YAL008W	597 nt		7.72	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	BUB2	YMR055C	921 nt		7.72	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	KRE1	YNL322C	942 nt		7.72	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	RSC9	YML127W	1746 nt		7.72	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	ADE5,7	YGL234W	2409 nt		7.71	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	MRN1	YPL184C	1839 nt		7.71	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	INO1	YJL153C	1602 nt		7.71	□□□□□ -1.17
VIK1	Q12045	YJR149W	YJR149W	1215 nt		7.71	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	GSF2	YML048W	1212 nt		7.71	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	FSH2	YMR222C	672 nt		7.71	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	GLY1	YEL046C	1164 nt		7.7	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	YER137C	YER137C	447 nt		7.7	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	RSM7	YJR113C	744 nt		7.7	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	HXT13	YEL069C	1695 nt		7.7	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	TUB4	YLR212C	1422 nt		7.69	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	AFG2	YLR397C	2343 nt		7.69	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	MEP1	YGR121C	1479 nt		7.69	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	STF1	YDL130W-A	261 nt		7.69	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	NIF3	YGL221C	867 nt		7.69	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	TGL5	YOR081C	2250 nt		7.69	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	THP3	YPR045C	1413 nt		7.69	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	BUD31	YCR063W	474 nt		7.68	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	YLR030W	YLR030W	792 nt		7.68	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	LRO1	YNR008W	1986 nt		7.66	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	YKR012C	YKR012C	378 nt		7.66	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	YJL045W	YJL045W	1905 nt		7.66	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	RPL12B	YDR418W	498 nt		7.65	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	BNA3	YJL060W	1335 nt		7.65	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	APT1	YML022W	564 nt		7.65	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	KTR4	YBR199W	1395 nt		7.65	□□□□□ -1.18
VIK1	Q12045	SDS24	YBR214W	1584 nt		7.64	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	PUS7	YOR243C	2031 nt		7.64	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	NAS2	YIL007C	663 nt		7.63	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	VBA3	YCL069W	1377 nt		7.62	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	TDA4	YJR116W	840 nt		7.62	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	YKR018C	YKR018C	2178 nt		7.61	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	FCP1	YMR277W	2199 nt		7.61	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	GUT1	YHL032C	2130 nt		7.6	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	MAL31	YBR298C	1845 nt		7.59	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	YBL111C	YBL111C	2004 nt		7.59	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	PRB1	YEL060C	1908 nt		7.59	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	MSB3	YNL293W	1902 nt		7.59	□□□□□ -1.19
VIK1	Q12045	YFR020W	YFR020W	699 nt		7.57	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	CKB1	YGL019W	837 nt		7.57	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	YLR460C	YLR460C	1131 nt		7.57	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	ENO1	YGR254W	1314 nt		7.56	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	PMT1	YDL095W	2454 nt		7.56	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	MRP7	YNL005C	1116 nt		7.56	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	DIP5	YPL265W	1827 nt		7.55	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	YGR068W-A	YGR068W-A	96 nt		7.55	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	EHT1	YBR177C	1356 nt		7.55	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	TOD6	YBL054W	1578 nt		7.54	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	CCR4	YAL021C	2514 nt		7.54	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	GNA1	YFL017C	480 nt		7.54	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	YGR137W	YGR137W	375 nt		7.54	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	CDD1	YLR245C	429 nt		7.54	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	RCF1	YML030W	480 nt		7.54	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	AVL9	YLR114C	2295 nt		7.53	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	ADH3	YMR083W	1128 nt		7.53	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	YNR001W-A	YNR001W-A	219 nt		7.53	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	PDC5	YLR134W	1692 nt		7.53	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	WSC3	YOL105C	1671 nt		7.53	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	RUP1	YOR138C	2016 nt		7.52	□□□□□ -1.2
VIK1	Q12045	YER152W-A	YER152W-A	567 nt		7.52	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	PHB2	YGR231C	933 nt		7.52	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	CPD1	YGR247W	720 nt		7.52	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	CHS7	YHR142W	951 nt		7.52	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	OLA1	YBR025C	1185 nt		7.52	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	YOR041C	YOR041C	432 nt		7.51	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	PEX28	YHR150W	1740 nt		7.51	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	SEC24	YIL109C	2781 nt		7.51	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	RFS1	YBR052C	633 nt		7.5	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	PPS1	YBR276C	2424 nt		7.49	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	STE4	YOR212W	1272 nt		7.49	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	CDC13	YDL220C	2775 nt		7.49	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	RMD8	YFR048W	1989 nt		7.48	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	TRR1	YDR353W	960 nt		7.48	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	IGD1	YFR017C	588 nt		7.48	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	MOB1	YIL106W	945 nt		7.48	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	RNA170	RNA170	169 nt		7.48	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	MET22	YOL064C	1074 nt		7.47	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	ALG7	YBR243C	1347 nt		7.47	□□□□□ -1.21
VIK1	Q12045	ARO3	YDR035W	1113 nt		7.46	□□□□□ -1.22

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