Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM27E3Q08E93 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM27E3Q08E93 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM27E3Q08E93 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM27E3Q08E93 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms