Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YLR036CYLR036C 612 nt7.9□□□□□ -1.14
AVO1Q08236 ZAP1YJL056C 2643 nt7.9□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 MSB3YNL293W 1902 nt7.9□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 DLD3YEL071W 1491 nt7.89□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 UBP13YBL067C 2244 nt7.89□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 MIX17YMR002W 471 nt7.89□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 PRE2YPR103W 864 nt7.89□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 MRS6YOR370C 1812 nt7.89□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 CKI1YLR133W 1749 nt7.89□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 DAL7YIR031C 1665 nt7.89□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YKL133CYKL133C 1392 nt7.88□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 POT1YIL160C 1254 nt7.88□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.88□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.88□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.88□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YMR262WYMR262W 942 nt7.87□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 EHD3YDR036C 1503 nt7.87□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 ITR2YOL103W 1830 nt7.87□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YNL040WYNL040W 1371 nt7.86□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YHR219WYHR219W 1875 nt7.86□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 LYS12YIL094C 1116 nt7.86□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 OPI3YJR073C 621 nt7.86□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YNR064CYNR064C 873 nt7.86□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 AAC3YBR085W 924 nt7.86□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 CIR2YOR356W 1896 nt7.85□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 TVP23YDR084C 600 nt7.85□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 SED5YLR026C 1023 nt7.85□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YLR311CYLR311C 348 nt7.85□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 LSR1LSR1 1175 nt7.85□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 NUP57YGR119C 1626 nt7.85□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 ELO1YJL196C 933 nt7.84□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 PEX12YMR026C 1200 nt7.84□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YMR114CYMR114C 1107 nt7.84□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 MRPL24YMR193W 777 nt7.84□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 ADH6YMR318C 1083 nt7.84□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 TIP1YBR067C 633 nt7.84□□□□□ -1.15
AVO1Q08236 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.83□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 NMD5YJR132W 3147 nt7.82□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 SVF1YDR346C 1446 nt7.82□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.82□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 VMA11YPL234C 495 nt7.82□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 PAU5YFL020C 369 nt7.81□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 RAI1YGL246C 1164 nt7.81□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 GSF2YML048W 1212 nt7.81□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 ASN2YGR124W 1719 nt7.81□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 HXT13YEL069C 1695 nt7.8□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 RPD3YNL330C 1302 nt7.79□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 YOS9YDR057W 1629 nt7.79□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 MAK32YCR019W 1092 nt7.79□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 APS2YJR058C 444 nt7.79□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 YRF1-2YER190W 5046 nt7.79□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 ENO2YHR174W 1314 nt7.78□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 TUB4YLR212C 1422 nt7.78□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 PTC7YHR076W 1032 nt7.78□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 ODC1YPL134C 933 nt7.78□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 YIL092WYIL092W 1902 nt7.78□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 NEM1YHR004C 1341 nt7.78□□□□□ -1.16
AVO1Q08236 KEL3YPL263C 1956 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 YMR265CYMR265C 1386 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 NIF3YGL221C 867 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 ESS1YJR017C 513 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 TIF34YMR146C 1044 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 PGC1YPL206C 966 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 AMF1YOR378W 1548 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 STD1YOR047C 1335 nt7.77□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 CDC13YDL220C 2775 nt7.76□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 BUD31YCR063W 474 nt7.76□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.76□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 ARC19YKL013C 516 nt7.76□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 SNX3YOR357C 489 nt7.76□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 TIM44YIL022W 1296 nt7.75□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 HAP5YOR358W 729 nt7.75□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 snR34snR34 203 nt7.75□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 TOP3YLR234W 1971 nt7.74□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 CWP2YKL096W-A 279 nt7.74□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 UBC12YLR306W 567 nt7.74□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 STP3YLR375W 1032 nt7.74□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 CBK1YNL161W 2271 nt7.74□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 SUV3YPL029W 2214 nt7.73□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 RPN14YGL004C 1254 nt7.73□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 KRE1YNL322C 942 nt7.73□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 ADE17YMR120C 1779 nt7.73□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 TPC1YGR096W 945 nt7.72□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 COX3Q0275 810 nt7.72□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 YMR074CYMR074C 438 nt7.72□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 SWT21YNL187W 1074 nt7.72□□□□□ -1.17
AVO1Q08236 snR31snR31 225 nt7.71□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 NBA1YOL070C 1506 nt7.7□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 PAR32YDL173W 888 nt7.7□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 YNR048WYNR048W 1182 nt7.7□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 SPE2YOL052C 1191 nt7.7□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 AME1YBR211C 975 nt7.7□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 YBR232CYBR232C 360 nt7.7□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 TOS2YGR221C 1869 nt7.7□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 HAL5YJL165C 2568 nt7.69□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 PRP2YNR011C 2631 nt7.69□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 RPC31YNL151C 756 nt7.69□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 YOL079WYOL079W 399 nt7.69□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 CRC1YOR100C 984 nt7.69□□□□□ -1.18
AVO1Q08236 KTR3YBR205W 1215 nt7.69□□□□□ -1.18
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