Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RELQ04864 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RELQ04864 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RELQ04864 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RELQ04864 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RELQ04864 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RELQ04864 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RELQ04864 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RELQ04864 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RELQ04864 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RELQ04864 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RELQ04864 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RELQ04864 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RELQ04864 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RELQ04864 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RELQ04864 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RELQ04864 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RELQ04864 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RELQ04864 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RELQ04864 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RELQ04864 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RELQ04864 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELQ04864 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELQ04864 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RELQ04864 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RELQ04864 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RELQ04864 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RELQ04864 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RELQ04864 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RELQ04864 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms