Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID5AQ03989 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARID5AQ03989 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID5AQ03989 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID5AQ03989 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID5AQ03989 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID5AQ03989 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID5AQ03989 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID5AQ03989 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID5AQ03989 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID5AQ03989 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID5AQ03989 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID5AQ03989 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID5AQ03989 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID5AQ03989 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID5AQ03989 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID5AQ03989 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARID5AQ03989 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID5AQ03989 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID5AQ03989 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARID5AQ03989 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARID5AQ03989 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID5AQ03989 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARID5AQ03989 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID5AQ03989 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID5AQ03989 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ARID5AQ03989 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARID5AQ03989 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID5AQ03989 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms