Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TOP2BQ02880 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
TOP2BQ02880 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
TOP2BQ02880 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
TOP2BQ02880 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
TOP2BQ02880 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
TOP2BQ02880 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
TOP2BQ02880 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms