Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms