Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFITM3Q01628 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFITM3Q01628 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFITM3Q01628 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFITM3Q01628 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms