Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGCS1Q01581 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGCS1Q01581 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCS1Q01581 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCS1Q01581 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms