Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SCN7AQ01118 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN7AQ01118 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN7AQ01118 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCN7AQ01118 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCN7AQ01118 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms