Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORDQ00796 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORDQ00796 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORDQ00796 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SORDQ00796 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORDQ00796 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORDQ00796 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SORDQ00796 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SORDQ00796 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORDQ00796 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORDQ00796 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORDQ00796 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORDQ00796 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORDQ00796 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORDQ00796 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORDQ00796 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORDQ00796 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SORDQ00796 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SORDQ00796 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORDQ00796 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORDQ00796 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORDQ00796 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORDQ00796 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORDQ00796 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORDQ00796 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SORDQ00796 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORDQ00796 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORDQ00796 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORDQ00796 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SORDQ00796 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SORDQ00796 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORDQ00796 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORDQ00796 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORDQ00796 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORDQ00796 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORDQ00796 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORDQ00796 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORDQ00796 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORDQ00796 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORDQ00796 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORDQ00796 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORDQ00796 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORDQ00796 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORDQ00796 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORDQ00796 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORDQ00796 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORDQ00796 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SORDQ00796 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORDQ00796 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORDQ00796 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORDQ00796 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORDQ00796 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORDQ00796 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORDQ00796 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SORDQ00796 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORDQ00796 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORDQ00796 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORDQ00796 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORDQ00796 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORDQ00796 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORDQ00796 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORDQ00796 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SORDQ00796 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORDQ00796 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORDQ00796 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SORDQ00796 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORDQ00796 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORDQ00796 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORDQ00796 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORDQ00796 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORDQ00796 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORDQ00796 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SORDQ00796 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORDQ00796 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORDQ00796 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORDQ00796 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORDQ00796 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORDQ00796 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORDQ00796 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORDQ00796 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORDQ00796 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORDQ00796 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORDQ00796 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms