Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSF1Q00613 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSF1Q00613 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HSF1Q00613 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSF1Q00613 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSF1Q00613 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms