Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCNA1P78396 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCNA1P78396 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCNA1P78396 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCNA1P78396 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNA1P78396 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCNA1P78396 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCNA1P78396 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCNA1P78396 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCNA1P78396 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms