Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PIP4K2BP78356 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PIP4K2BP78356 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIP4K2BP78356 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIP4K2BP78356 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIP4K2BP78356 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIP4K2BP78356 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIP4K2BP78356 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PIP4K2BP78356 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PIP4K2BP78356 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PIP4K2BP78356 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PIP4K2BP78356 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PIP4K2BP78356 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
PIP4K2BP78356 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms