Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPAN5P62079 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPAN5P62079 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TSPAN5P62079 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSPAN5P62079 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN5P62079 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms