Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2KP61086 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2KP61086 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2KP61086 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2KP61086 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms