Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA6P60900 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMA6P60900 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA6P60900 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms