Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVFC1-1P60608 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVFC1-1P60608 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFC1-1P60608 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms