Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ROMO1P60602 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ROMO1P60602 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms