Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL3P58215 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LOXL3P58215 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LOXL3P58215 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms