Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX8P57073 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX8P57073 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX8P57073 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX8P57073 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX8P57073 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX8P57073 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX8P57073 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX8P57073 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX8P57073 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX8P57073 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX8P57073 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX8P57073 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX8P57073 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX8P57073 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX8P57073 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX8P57073 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX8P57073 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX8P57073 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX8P57073 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX8P57073 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX8P57073 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX8P57073 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX8P57073 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX8P57073 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX8P57073 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX8P57073 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX8P57073 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX8P57073 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX8P57073 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX8P57073 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX8P57073 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX8P57073 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX8P57073 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX8P57073 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX8P57073 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX8P57073 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX8P57073 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX8P57073 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX8P57073 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX8P57073 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX8P57073 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX8P57073 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX8P57073 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX8P57073 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX8P57073 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX8P57073 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX8P57073 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX8P57073 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX8P57073 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX8P57073 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX8P57073 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX8P57073 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX8P57073 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX8P57073 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX8P57073 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX8P57073 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX8P57073 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX8P57073 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX8P57073 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX8P57073 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX8P57073 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX8P57073 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX8P57073 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX8P57073 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX8P57073 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX8P57073 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX8P57073 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOX8P57073 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX8P57073 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX8P57073 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX8P57073 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX8P57073 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOX8P57073 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOX8P57073 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX8P57073 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOX8P57073 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX8P57073 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX8P57073 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX8P57073 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX8P57073 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOX8P57073 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOX8P57073 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms