Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BACE1P56817 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BACE1P56817 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BACE1P56817 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BACE1P56817 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BACE1P56817 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BACE1P56817 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BACE1P56817 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BACE1P56817 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BACE1P56817 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BACE1P56817 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BACE1P56817 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BACE1P56817 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BACE1P56817 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BACE1P56817 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BACE1P56817 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BACE1P56817 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BACE1P56817 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BACE1P56817 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BACE1P56817 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BACE1P56817 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BACE1P56817 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BACE1P56817 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BACE1P56817 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BACE1P56817 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BACE1P56817 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BACE1P56817 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BACE1P56817 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BACE1P56817 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BACE1P56817 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
BACE1P56817 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BACE1P56817 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BACE1P56817 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BACE1P56817 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BACE1P56817 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BACE1P56817 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BACE1P56817 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BACE1P56817 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BACE1P56817 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BACE1P56817 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BACE1P56817 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BACE1P56817 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
BACE1P56817 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BACE1P56817 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BACE1P56817 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BACE1P56817 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BACE1P56817 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BACE1P56817 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BACE1P56817 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BACE1P56817 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BACE1P56817 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BACE1P56817 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
BACE1P56817 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BACE1P56817 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BACE1P56817 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BACE1P56817 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BACE1P56817 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BACE1P56817 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BACE1P56817 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BACE1P56817 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BACE1P56817 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BACE1P56817 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BACE1P56817 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BACE1P56817 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BACE1P56817 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BACE1P56817 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BACE1P56817 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BACE1P56817 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BACE1P56817 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BACE1P56817 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BACE1P56817 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BACE1P56817 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
BACE1P56817 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BACE1P56817 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BACE1P56817 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BACE1P56817 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BACE1P56817 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BACE1P56817 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BACE1P56817 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BACE1P56817 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BACE1P56817 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BACE1P56817 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BACE1P56817 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BACE1P56817 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BACE1P56817 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BACE1P56817 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BACE1P56817 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BACE1P56817 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BACE1P56817 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BACE1P56817 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BACE1P56817 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BACE1P56817 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BACE1P56817 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BACE1P56817 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BACE1P56817 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BACE1P56817 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BACE1P56817 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BACE1P56817 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BACE1P56817 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BACE1P56817 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms