Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MFAP3P55082 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MFAP3P55082 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MFAP3P55082 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MFAP3P55082 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFAP3P55082 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFAP3P55082 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
MFAP3P55082 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MFAP3P55082 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MFAP3P55082 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MFAP3P55082 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MFAP3P55082 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MFAP3P55082 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MFAP3P55082 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MFAP3P55082 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MFAP3P55082 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MFAP3P55082 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFAP3P55082 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms