Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A1P54219 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC18A1P54219 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC18A1P54219 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC18A1P54219 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A1P54219 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms