Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGGTBP53611 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RABGGTBP53611 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGGTBP53611 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RABGGTBP53611 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RABGGTBP53611 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms