Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF138P52744 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF138P52744 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF138P52744 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF138P52744 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF138P52744 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF138P52744 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms