Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDR1P51861 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDR1P51861 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDR1P51861 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDR1P51861 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDR1P51861 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDR1P51861 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDR1P51861 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDR1P51861 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDR1P51861 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDR1P51861 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDR1P51861 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDR1P51861 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDR1P51861 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDR1P51861 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDR1P51861 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDR1P51861 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDR1P51861 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDR1P51861 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDR1P51861 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDR1P51861 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDR1P51861 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDR1P51861 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDR1P51861 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDR1P51861 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDR1P51861 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDR1P51861 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDR1P51861 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDR1P51861 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDR1P51861 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDR1P51861 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDR1P51861 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDR1P51861 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDR1P51861 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDR1P51861 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDR1P51861 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDR1P51861 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDR1P51861 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDR1P51861 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDR1P51861 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDR1P51861 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDR1P51861 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDR1P51861 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDR1P51861 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDR1P51861 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDR1P51861 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDR1P51861 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDR1P51861 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDR1P51861 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDR1P51861 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDR1P51861 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDR1P51861 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDR1P51861 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDR1P51861 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDR1P51861 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDR1P51861 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDR1P51861 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDR1P51861 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDR1P51861 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDR1P51861 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDR1P51861 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDR1P51861 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDR1P51861 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDR1P51861 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDR1P51861 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDR1P51861 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDR1P51861 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDR1P51861 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDR1P51861 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDR1P51861 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDR1P51861 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDR1P51861 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDR1P51861 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDR1P51861 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDR1P51861 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDR1P51861 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDR1P51861 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDR1P51861 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms