Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms