Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN5P51795 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLCN5P51795 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLCN5P51795 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLCN5P51795 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLCN5P51795 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms