Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB13P51153 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB13P51153 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB13P51153 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB13P51153 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB13P51153 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB13P51153 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB13P51153 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB13P51153 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB13P51153 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB13P51153 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB13P51153 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB13P51153 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB13P51153 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB13P51153 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB13P51153 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB13P51153 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB13P51153 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB13P51153 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB13P51153 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB13P51153 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB13P51153 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB13P51153 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB13P51153 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB13P51153 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB13P51153 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB13P51153 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB13P51153 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB13P51153 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB13P51153 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB13P51153 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB13P51153 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB13P51153 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB13P51153 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB13P51153 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB13P51153 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB13P51153 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB13P51153 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB13P51153 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB13P51153 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB13P51153 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB13P51153 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB13P51153 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB13P51153 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB13P51153 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB13P51153 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB13P51153 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB13P51153 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB13P51153 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB13P51153 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB13P51153 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB13P51153 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB13P51153 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB13P51153 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB13P51153 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB13P51153 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB13P51153 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB13P51153 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB13P51153 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB13P51153 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB13P51153 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB13P51153 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB13P51153 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB13P51153 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB13P51153 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB13P51153 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB13P51153 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB13P51153 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB13P51153 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB13P51153 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB13P51153 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB13P51153 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB13P51153 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB13P51153 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB13P51153 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB13P51153 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB13P51153 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB13P51153 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB13P51153 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB13P51153 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB13P51153 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB13P51153 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB13P51153 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB13P51153 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB13P51153 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB13P51153 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB13P51153 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms