Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAPOLAP51003 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PAPOLAP51003 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAPOLAP51003 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPOLAP51003 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms