Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK9P50750 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK9P50750 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK9P50750 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK9P50750 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK9P50750 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK9P50750 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK9P50750 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK9P50750 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK9P50750 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK9P50750 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK9P50750 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK9P50750 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK9P50750 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK9P50750 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK9P50750 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK9P50750 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK9P50750 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK9P50750 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK9P50750 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK9P50750 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK9P50750 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK9P50750 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK9P50750 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK9P50750 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK9P50750 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK9P50750 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK9P50750 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK9P50750 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK9P50750 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK9P50750 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK9P50750 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK9P50750 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK9P50750 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK9P50750 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK9P50750 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK9P50750 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK9P50750 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK9P50750 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK9P50750 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK9P50750 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK9P50750 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK9P50750 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK9P50750 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK9P50750 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK9P50750 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK9P50750 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK9P50750 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK9P50750 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK9P50750 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK9P50750 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK9P50750 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK9P50750 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK9P50750 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK9P50750 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK9P50750 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK9P50750 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK9P50750 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK9P50750 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK9P50750 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK9P50750 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK9P50750 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK9P50750 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK9P50750 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK9P50750 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK9P50750 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK9P50750 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK9P50750 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK9P50750 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK9P50750 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK9P50750 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK9P50750 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK9P50750 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK9P50750 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK9P50750 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK9P50750 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK9P50750 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK9P50750 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK9P50750 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK9P50750 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK9P50750 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK9P50750 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK9P50750 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms