Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERFP50548 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERFP50548 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERFP50548 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERFP50548 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERFP50548 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERFP50548 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERFP50548 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERFP50548 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERFP50548 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERFP50548 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERFP50548 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERFP50548 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERFP50548 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERFP50548 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERFP50548 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERFP50548 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERFP50548 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERFP50548 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERFP50548 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERFP50548 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERFP50548 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERFP50548 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERFP50548 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERFP50548 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERFP50548 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERFP50548 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERFP50548 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERFP50548 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERFP50548 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERFP50548 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERFP50548 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERFP50548 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERFP50548 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERFP50548 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERFP50548 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERFP50548 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERFP50548 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERFP50548 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ERFP50548 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERFP50548 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERFP50548 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERFP50548 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERFP50548 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERFP50548 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERFP50548 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERFP50548 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERFP50548 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERFP50548 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERFP50548 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERFP50548 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERFP50548 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERFP50548 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERFP50548 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERFP50548 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERFP50548 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERFP50548 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERFP50548 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERFP50548 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERFP50548 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERFP50548 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERFP50548 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERFP50548 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERFP50548 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERFP50548 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERFP50548 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERFP50548 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERFP50548 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERFP50548 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERFP50548 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERFP50548 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERFP50548 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERFP50548 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERFP50548 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERFP50548 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERFP50548 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERFP50548 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERFP50548 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERFP50548 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERFP50548 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERFP50548 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERFP50548 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERFP50548 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERFP50548 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERFP50548 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERFP50548 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERFP50548 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERFP50548 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERFP50548 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERFP50548 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERFP50548 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms